Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fam228bQ497Q6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam228bQ497Q6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Fam228bQ497Q6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms