Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pacs2Q3V3Q7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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