Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnaaf3Q3UYV8 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnaaf3Q3UYV8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms