Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C87499Q3UX49 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C87499Q3UX49 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C87499Q3UX49 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms