Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BB287469Q3UT53 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BB287469Q3UT53 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms