Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rtl4Q3URY0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rtl4Q3URY0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms