Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJU9

Rmdn3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmdn3Q3UJU9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rmdn3Q3UJU9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rmdn3Q3UJU9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rmdn3Q3UJU9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms