Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Wdr41Q3UDP0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Wdr41Q3UDP0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms