Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TchpQ3TVW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TchpQ3TVW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TchpQ3TVW5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.7 ms