Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam172aQ3TNH5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam172aQ3TNH5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam172aQ3TNH5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms