Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trappc10Q3TLI0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trappc10Q3TLI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Trappc10Q3TLI0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms