Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gtf2f1Q3THK3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gtf2f1Q3THK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2f1Q3THK3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms