Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VrtnQ3SYK4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VrtnQ3SYK4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VrtnQ3SYK4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms