Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDRF1Q3B7T1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDRF1Q3B7T1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EDRF1Q3B7T1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms