Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FXNQ16595 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXNQ16595 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXNQ16595 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXNQ16595 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXNQ16595 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FXNQ16595 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FXNQ16595 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FXNQ16595 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FXNQ16595 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FXNQ16595 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FXNQ16595 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FXNQ16595 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FXNQ16595 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FXNQ16595 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FXNQ16595 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FXNQ16595 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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