Protein–RNA interactions for Protein: Q13477

MADCAM1, Mucosal addressin cell adhesion molecule 1, humanhuman

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Length 382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MADCAM1Q13477 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MADCAM1Q13477 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MADCAM1Q13477 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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