Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALCOCO2Q13137 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CALCOCO2Q13137 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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