Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NFIAQ12857 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NFIAQ12857 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NFIAQ12857 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
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