Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zc3h18Q0P678 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zc3h18Q0P678 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zc3h18Q0P678 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms