Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Siah2Q06986 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms