Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CTDSPL2Q05D32 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTDSPL2Q05D32 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms