Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Sdr16c6Q05A13 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sdr16c6Q05A13 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sdr16c6Q05A13 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 290.6 ms