Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL6Q02878 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL6Q02878 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms