Protein–RNA interactions for Protein: Q02819

Nucb1, Nucleobindin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nucb1Q02819 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nucb1Q02819 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nucb1Q02819 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nucb1Q02819 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms