Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TFAMQ00059 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFAMQ00059 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFAMQ00059 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms