Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FGD1P98174 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FGD1P98174 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD1P98174 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD1P98174 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD1P98174 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD1P98174 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FGD1P98174 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD1P98174 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD1P98174 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD1P98174 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FGD1P98174 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FGD1P98174 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FGD1P98174 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FGD1P98174 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD1P98174 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD1P98174 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FGD1P98174 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD1P98174 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD1P98174 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FGD1P98174 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FGD1P98174 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FGD1P98174 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD1P98174 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD1P98174 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD1P98174 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD1P98174 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD1P98174 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FGD1P98174 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FGD1P98174 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD1P98174 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD1P98174 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD1P98174 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD1P98174 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD1P98174 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FGD1P98174 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FGD1P98174 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms