Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tarbp2P97473 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tarbp2P97473 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms