Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pkp1P97350 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pkp1P97350 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkp1P97350 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms