Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	YPL260W	YPL260W	1656 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ULS1	YOR191W	4860 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	snR7-S	snR7-S	179 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PRM10	YJL108C	1152 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	LSO1	YJR005C-A	282 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YPL113C	YPL113C	1191 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	DRN1	YGR093W	1524 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	AKL1	YBR059C	3327 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	FAS2	YPL231W	5664 nt		3.02	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	VHC1	YBR235W	3363 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	SET5	YHR207C	1581 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	RNA15	YGL044C	891 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	DCD1	YHR144C	939 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	CDC42	YLR229C	576 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	RPO21	YDL140C	5202 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PRD1	YCL057W	2139 nt		3.01	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	OLE1	YGL055W	1533 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	CPR4	YCR069W	957 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ARG82	YDR173C	1068 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	SNA2	YDR525W-A	240 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	IRC7	YFR055W	1023 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ARO2	YGL148W	1131 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PEX22	YAL055W	543 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YNL194C	YNL194C	906 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YPR169W-A	YPR169W-A	219 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YPR170W-B	YPR170W-B	258 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	FUM1	YPL262W	1467 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ENP1	YBR247C	1452 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	HIR2	YOR038C	2628 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ATG2	YNL242W	4779 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PAH1	YMR165C	2589 nt		3	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	VAC7	YNL054W	3498 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	SAP4	YGL229C	2457 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	CTT1	YGR088W	1689 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	VAM7	YGL212W	951 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	NAT2	YGR147C	867 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YHL034W-A	YHL034W-A	462 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	TVP38	YKR088C	1014 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PDR16	YNL231C	1056 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PAP2	YOL115W	1755 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ASK10	YGR097W	3441 nt		2.99	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	RPO31	YOR116C	4383 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PEP5	YMR231W	3090 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	VPS29	YHR012W	849 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YJR012C	YJR012C	624 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YPK9	YOR291W	4419 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	CDC48	YDL126C	2508 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	CAB3	YKL088W	1716 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	SWC3	YAL011W	1878 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	MSC2	YDR205W	2175 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PMC1	YGL006W	3522 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	FDC1	YDR539W	1512 nt		2.98	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	SWI3	YJL176C	2478 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	MET4	YNL103W	2019 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	GRC3	YLL035W	1899 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	TRM44	YPL030W	1704 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	MTC1	YJL123C	1437 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	WTM2	YOR229W	1404 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	PER1	YCR044C	1074 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	NUP42	YDR192C	1293 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YGR066C	YGR066C	879 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	APS1	YLR170C	471 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	YNL108C	YNL108C	813 nt		2.97	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	ZPR1	YGR211W	1461 nt		2.96	□□□□□ -1.93
DDR2	P89113	MSS1	YMR023C	1581 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	XKS1	YGR194C	1803 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	YJL218W	YJL218W	591 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	UBI4	YLL039C	1146 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	MRPL39	YML009C	213 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	POP4	YBR257W	840 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	CBF5	YLR175W	1452 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	PDR5	YOR153W	4536 nt		2.96	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	IMD2	YHR216W	1572 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	GPR1	YDL035C	2886 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	ESF1	YDR365C	1887 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	HAL5	YJL165C	2568 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	ARF2	YDL137W	546 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	COA3	YJL062W-A	258 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	ERG3	YLR056W	1098 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	SAP30	YMR263W	606 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	YPL191C	YPL191C	1083 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	GRE1	YPL223C	507 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	CMR1	YDL156W	1569 nt		2.95	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	CYM1	YDR430C	2970 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	FAA3	YIL009W	2085 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	PSE1	YMR308C	3270 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	STR2	YJR130C	1920 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	FBP1	YLR377C	1047 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	MRPL4	YLR439W	960 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	TOM7	YNL070W	183 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	ARG8	YOL140W	1272 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	PRP28	YDR243C	1767 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	HRK1	YOR267C	2280 nt		2.94	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	RIM21	YNL294C	1602 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	ALG6	YOR002W	1635 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	GAD1	YMR250W	1758 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	SEN1	YLR430W	6696 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	SCS2	YER120W	735 nt		2.93	□□□□□ -1.94
DDR2	P89113	CAB4	YGR277C	918 nt		2.93	□□□□□ -1.94

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