Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
IRX5P78411 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRX5P78411 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
IRX5P78411 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
IRX5P78411 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
IRX5P78411 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX5P78411 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX5P78411 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX5P78411 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IRX5P78411 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
IRX5P78411 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX5P78411 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX5P78411 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX5P78411 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX5P78411 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX5P78411 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
IRX5P78411 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IRX5P78411 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX5P78411 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX5P78411 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
IRX5P78411 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
IRX5P78411 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
IRX5P78411 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX5P78411 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX5P78411 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX5P78411 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX5P78411 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IRX5P78411 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX5P78411 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX5P78411 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX5P78411 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX5P78411 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
IRX5P78411 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
IRX5P78411 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX5P78411 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX5P78411 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX5P78411 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX5P78411 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX5P78411 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
IRX5P78411 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms