Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux2P70298 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Cux2P70298 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Cux2P70298 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux2P70298 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux2P70298 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux2P70298 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux2P70298 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Cux2P70298 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
Cux2P70298 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cux2P70298 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux2P70298 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux2P70298 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Cux2P70298 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms