Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GNB1P62873 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GNB1P62873 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB1P62873 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB1P62873 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB1P62873 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB1P62873 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB1P62873 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GNB1P62873 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GNB1P62873 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GNB1P62873 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GNB1P62873 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GNB1P62873 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GNB1P62873 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB1P62873 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms