Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps11P62281 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps11P62281 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rps11P62281 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps11P62281 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps11P62281 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps11P62281 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rps11P62281 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms