Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nol4P60954 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nol4P60954 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nol4P60954 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms