Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snap25P60879 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Snap25P60879 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Snap25P60879 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap25P60879 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap25P60879 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap25P60879 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Snap25P60879 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms