Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Nphp4P59240 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nphp4P59240 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nphp4P59240 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nphp4P59240 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms