Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Samsn1P57725 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samsn1P57725 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samsn1P57725 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms