Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SIK1P57059 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SIK1P57059 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SIK1P57059 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SIK1P57059 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIK1P57059 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SIK1P57059 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIK1P57059 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SIK1P57059 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIK1P57059 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIK1P57059 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIK1P57059 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIK1P57059 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SIK1P57059 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIK1P57059 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SIK1P57059 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SIK1P57059 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SIK1P57059 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIK1P57059 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIK1P57059 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIK1P57059 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SIK1P57059 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIK1P57059 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SIK1P57059 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SIK1P57059 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SIK1P57059 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms