Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 ATP2A2-212ENST00000553144 264 ntTSL 1 (best)3.72□□□□□ -1.815e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NSMCE4A-208ENST00000477289 643 ntTSL 23.54□□□□□ -1.845e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 ERAP1-208ENST00000512852 632 ntTSL 32.89□□□□□ -1.955e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -25e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 NSMCE4A-203ENST00000459911 541 ntTSL 20.96□□□□□ -2.265e-8■■■■■ 37.7
SUB1P53999 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.715e-36■■■■■ 37.6
SUB1P53999 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.185e-36■■■■■ 37.6
SUB1P53999 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 37.6
SUB1P53999 COPB1-208ENST00000532088 510 ntTSL 39.78□□□□□ -0.846e-12■■■■■ 37.5
SUB1P53999 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.136e-12■■■■■ 37.5
SUB1P53999 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.226e-12■■■■■ 37.5
SUB1P53999 COPB1-203ENST00000525214 566 ntTSL 22.1□□□□□ -2.076e-12■■■■■ 37.5
SUB1P53999 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 37.52□□□□□ -1.211e-8■■■■■ 37.5
SUB1P53999 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-8■■■■■ 37.4
SUB1P53999 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 37.4
SUB1P53999 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.496e-7■■■■■ 37.4
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SUB1P53999 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 37.4
SUB1P53999 RRM1-213ENST00000533495 2381 ntTSL 23.74□□□□□ -1.816e-7■■■■■ 37.4
SUB1P53999 CLNS1A-201ENST00000263309 1172 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 37.3
SUB1P53999 CLNS1A-204ENST00000525428 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 37.3
SUB1P53999 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 37.3
SUB1P53999 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.737e-10■■■■■ 37.3
SUB1P53999 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.967e-10■■■■■ 37.3
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SUB1P53999 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.076e-14■■■■■ 37.3
SUB1P53999 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.166e-14■■■■■ 37.3
SUB1P53999 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.576e-14■■■■■ 37.3
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SUB1P53999 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.696e-14■■■■■ 37.3
SUB1P53999 OARD1-210ENST00000479950 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.096e-14■■■■■ 37.3
SUB1P53999 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.716e-14■■■■■ 37.3
SUB1P53999 OXCT1-201ENST00000196371 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.044e-7■■■■■ 37.2
SUB1P53999 OXCT1-205ENST00000510634 1441 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 37.2
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SUB1P53999 ETFA-201ENST00000267950 1289 ntTSL 516.5■□□□□ 0.235e-14■■■■■ 37.1
SUB1P53999 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.025e-14■■■■■ 37.1
SUB1P53999 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.245e-14■■■■■ 37.1
SUB1P53999 TUBA1A-202ENST00000301071 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 37.1
SUB1P53999 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-9■■■■■ 37.1
SUB1P53999 COX4I1-212ENST00000566617 572 ntTSL 421.63■■□□□ 1.051e-14■■■■■ 37.1
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SUB1P53999 COX4I1-214ENST00000567266 546 ntTSL 415.17■□□□□ 0.021e-14■■■■■ 37.1
SUB1P53999 COX4I1-213ENST00000567241 561 ntTSL 414.1□□□□□ -0.151e-14■■■■■ 37.1
SUB1P53999 COX4I1-210ENST00000566115 471 ntTSL 311.98□□□□□ -0.491e-14■■■■■ 37.1
SUB1P53999 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 37
SUB1P53999 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 37
SUB1P53999 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.966e-8■■■■■ 37
SUB1P53999 GLRX5-203ENST00000557731 1863 ntTSL 511.55□□□□□ -0.566e-8■■■■■ 37
SUB1P53999 RAN-201ENST00000392367 780 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.543e-13■■■■■ 37
SUB1P53999 EPRS-203ENST00000468487 458 ntTSL 23.41□□□□□ -1.865e-9■■■■■ 36.9
SUB1P53999 PPIA-205ENST00000479021 552 ntTSL 48.33□□□□□ -1.089e-9■■■■■ 36.9
SUB1P53999 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.419e-9■■■■■ 36.9
SUB1P53999 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 36.9
SUB1P53999 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 36.9
SUB1P53999 CKB-204ENST00000553652 1239 ntTSL 514.03□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 36.9
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SUB1P53999 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.331e-8■■■■■ 36.8
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SUB1P53999 RILPL1-201ENST00000340724 2389 ntTSL 511.48□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 36.7
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SUB1P53999 PSME1-207ENST00000560420 922 ntTSL 210.95□□□□□ -0.668e-11■■■■■ 36.7
SUB1P53999 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.728e-11■■■■■ 36.7
SUB1P53999 PSME1-210ENST00000561435 945 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.138e-11■■■■■ 36.7
SUB1P53999 PSME1-206ENST00000559741 763 ntTSL 37.6□□□□□ -1.198e-11■■■■■ 36.7
SUB1P53999 PSME1-204ENST00000558112 651 ntTSL 56.78□□□□□ -1.328e-11■■■■■ 36.7
SUB1P53999 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.672e-6■■■■■ 36.7
SUB1P53999 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 36.7
SUB1P53999 AC097637.1-201ENST00000494383 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 36.7
SUB1P53999 NDRG2-210ENST00000397856 1309 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 36.7
SUB1P53999 NDRG2-212ENST00000403829 1500 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 36.7
SUB1P53999 AC097637.1-202ENST00000478201 570 ntTSL 27.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.277e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-222ENST00000570086 801 ntTSL 312.41□□□□□ -0.427e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.627e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-220ENST00000569187 612 ntTSL 211.14□□□□□ -0.637e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.837e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-218ENST00000567593 919 ntTSL 37.84□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-223ENST00000570195 871 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.157e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-206ENST00000563779 2087 ntTSL 1 (best)5.18□□□□□ -1.587e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-217ENST00000566918 605 ntTSL 34.03□□□□□ -1.767e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-203ENST00000561614 683 ntTSL 32.96□□□□□ -1.947e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.947e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-216ENST00000566231 652 ntTSL 32.59□□□□□ -1.997e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 CMC2-215ENST00000566047 660 ntTSL 22.07□□□□□ -2.087e-9■■■■■ 36.7
SUB1P53999 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 36.7
SUB1P53999 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.462e-12■■■■■ 36.7
SUB1P53999 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-12■■■■■ 36.7
SUB1P53999 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.712e-12■■■■■ 36.7
SUB1P53999 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.867e-8■■■■■ 36.7
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