Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 SAP4YGL229C 2457 nt5.73□□□□□ -1.49
HEF3P53978 AXL2YIL140W 2472 nt5.73□□□□□ -1.49
HEF3P53978 SET5YHR207C 1581 nt5.72□□□□□ -1.49
HEF3P53978 UBP9YER098W 2265 nt5.72□□□□□ -1.49
HEF3P53978 ALG6YOR002W 1635 nt5.72□□□□□ -1.49
HEF3P53978 CBT1YKL208W 816 nt5.71□□□□□ -1.5
HEF3P53978 ECM23YPL021W 564 nt5.71□□□□□ -1.5
HEF3P53978 ARO10YDR380W 1908 nt5.71□□□□□ -1.5
HEF3P53978 ROG3YFR022W 2202 nt5.71□□□□□ -1.5
HEF3P53978 CNM67YNL225C 1746 nt5.71□□□□□ -1.5
HEF3P53978 FLC3YGL139W 2409 nt5.7□□□□□ -1.5
HEF3P53978 RAD28YDR030C 1521 nt5.7□□□□□ -1.5
HEF3P53978 SNA2YDR525W-A 240 nt5.7□□□□□ -1.5
HEF3P53978 RRN3YKL125W 1884 nt5.7□□□□□ -1.5
HEF3P53978 CRT10YOL063C 2874 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 DBF4YDR052C 2115 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 SDA1YGR245C 2304 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 KRE6YPR159W 2163 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 TAF5YBR198C 2397 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 COX17YLL009C 210 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 SAF1YBR280C 1914 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 ZPR1YGR211W 1461 nt5.69□□□□□ -1.5
HEF3P53978 UTP9YHR196W 1728 nt5.68□□□□□ -1.5
HEF3P53978 COA3YJL062W-A 258 nt5.68□□□□□ -1.5
HEF3P53978 OAZ1YPL052W 879 nt5.68□□□□□ -1.5
HEF3P53978 VBA1YMR088C 1689 nt5.68□□□□□ -1.5
HEF3P53978 NMD3YHR170W 1557 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 SEC18YBR080C 2277 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 SIR2YDL042C 1689 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 ARG82YDR173C 1068 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 TYW3YGL050W 822 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 CIA2YHR122W 696 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 URE2YNL229C 1065 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 RCL1YOL010W 1104 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 CDS1YBR029C 1374 nt5.67□□□□□ -1.5
HEF3P53978 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 NOP58YOR310C 1536 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 LHP1YDL051W 828 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 UBI4YLL039C 1146 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 TAF11YML015C 1041 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 OCA1YNL099C 717 nt5.66□□□□□ -1.5
HEF3P53978 GAD1YMR250W 1758 nt5.65□□□□□ -1.5
HEF3P53978 RRB1YMR131C 1536 nt5.65□□□□□ -1.5
HEF3P53978 PHO90YJL198W 2646 nt5.65□□□□□ -1.51
HEF3P53978 TPS3YMR261C 3165 nt5.65□□□□□ -1.51
HEF3P53978 SIP5YMR140W 1470 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 ACP1YKL192C 378 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 RGS2YOR107W 930 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 MSC2YDR205W 2175 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 MPS3YJL019W 2049 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 ALD3YMR169C 1521 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 ALD2YMR170C 1521 nt5.64□□□□□ -1.51
HEF3P53978 VPS72YDR485C 2388 nt5.63□□□□□ -1.51
HEF3P53978 JJJ3YJR097W 519 nt5.63□□□□□ -1.51
HEF3P53978 GLT1YDL171C 6438 nt5.63□□□□□ -1.51
HEF3P53978 FAA4YMR246W 2085 nt5.63□□□□□ -1.51
HEF3P53978 EUG1YDR518W 1554 nt5.63□□□□□ -1.51
HEF3P53978 CPS1YJL172W 1731 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 CPR4YCR069W 957 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 ODC2YOR222W 924 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 SPO19YPL130W 672 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 PDB1YBR221C 1101 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 PSY4YBL046W 1326 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 HOS2YGL194C 1359 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 PRP40YKL012W 1752 nt5.62□□□□□ -1.51
HEF3P53978 MNN4YKL201C 3537 nt5.61□□□□□ -1.51
HEF3P53978 CAF4YKR036C 1932 nt5.61□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YGP1YNL160W 1065 nt5.61□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YNL247WYNL247W 2304 nt5.61□□□□□ -1.51
HEF3P53978 GUP2YPL189W 1830 nt5.61□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YOR1YGR281W 4434 nt5.61□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YKR073CYKR073C 321 nt5.6□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YAR023CYAR023C 540 nt5.6□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YMR147WYMR147W 672 nt5.6□□□□□ -1.51
HEF3P53978 HMT1YBR034C 1047 nt5.6□□□□□ -1.51
HEF3P53978 ERG7YHR072W 2196 nt5.6□□□□□ -1.51
HEF3P53978 TDA6YPR157W 1404 nt5.59□□□□□ -1.51
HEF3P53978 SPR6YER115C 576 nt5.59□□□□□ -1.51
HEF3P53978 SEC17YBL050W 879 nt5.59□□□□□ -1.51
HEF3P53978 YNL108CYNL108C 813 nt5.59□□□□□ -1.51
HEF3P53978 SSH4YKL124W 1740 nt5.59□□□□□ -1.51
HEF3P53978 GUS1YGL245W 2127 nt5.59□□□□□ -1.52
HEF3P53978 ATG18YFR021W 1503 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 CEG1YGL130W 1380 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 RBA50YDR527W 1320 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 EAF5YEL018W 840 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 NAT2YGR147C 867 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 SFK1YKL051W 1062 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 AST1YBL069W 1290 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 ECM2YBR065C 1095 nt5.58□□□□□ -1.52
HEF3P53978 HOS1YPR068C 1413 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 YHR182WYHR182W 2358 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 YDR396WYDR396W 501 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 RMR1YGL250W 726 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 RFC2YJR068W 1062 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 DBR1YKL149C 1218 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 YNL194CYNL194C 906 nt5.57□□□□□ -1.52
HEF3P53978 RTC1YOL138C 4026 nt5.57□□□□□ -1.52
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