Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhox5P52651 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhox5P52651 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms