Protein–RNA interactions for Protein: P51675

Ccr1, C-C chemokine receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr1P51675 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccr1P51675 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccr1P51675 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccr1P51675 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms