Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC10P48553 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRAPPC10P48553 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRAPPC10P48553 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms