Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cdkn1bP46414 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms