Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Klf1P46099 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Klf1P46099 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klf1P46099 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf1P46099 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klf1P46099 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Klf1P46099 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms