Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GRIA3P42263 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GRIA3P42263 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms