Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TfamP40630 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TfamP40630 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TfamP40630 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TfamP40630 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TfamP40630 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TfamP40630 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TfamP40630 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TfamP40630 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TfamP40630 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TfamP40630 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TfamP40630 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TfamP40630 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TfamP40630 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms