Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Chd1P40201 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Chd1P40201 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Chd1P40201 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Chd1P40201 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Chd1P40201 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Chd1P40201 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Chd1P40201 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Chd1P40201 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Chd1P40201 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Chd1P40201 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd1P40201 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Chd1P40201 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Chd1P40201 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms