Protein–RNA interactions for Protein: P39749

Fen1, Flap endonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fen1P39749 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fen1P39749 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fen1P39749 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms