Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Upk2P38575 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Upk2P38575 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.8 ms